Protein–RNA interactions for Protein: P46737

Brcc3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brcc3P46737 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Brcc3P46737 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brcc3P46737 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms