Protein–RNA interactions for Protein: P46686

Tulp2, Tubby-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp2P46686 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tulp2P46686 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tulp2P46686 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tulp2P46686 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tulp2P46686 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tulp2P46686 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tulp2P46686 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tulp2P46686 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tulp2P46686 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tulp2P46686 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tulp2P46686 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tulp2P46686 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tulp2P46686 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tulp2P46686 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tulp2P46686 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tulp2P46686 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tulp2P46686 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tulp2P46686 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tulp2P46686 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tulp2P46686 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tulp2P46686 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tulp2P46686 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tulp2P46686 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tulp2P46686 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tulp2P46686 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tulp2P46686 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tulp2P46686 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tulp2P46686 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tulp2P46686 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tulp2P46686 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tulp2P46686 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tulp2P46686 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tulp2P46686 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tulp2P46686 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tulp2P46686 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tulp2P46686 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tulp2P46686 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tulp2P46686 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tulp2P46686 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tulp2P46686 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tulp2P46686 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tulp2P46686 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms