Protein–RNA interactions for Protein: P43135

Nr2f2, COUP transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f2P43135 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr2f2P43135 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr2f2P43135 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr2f2P43135 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr2f2P43135 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr2f2P43135 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr2f2P43135 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr2f2P43135 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr2f2P43135 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr2f2P43135 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr2f2P43135 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr2f2P43135 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr2f2P43135 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr2f2P43135 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr2f2P43135 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr2f2P43135 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr2f2P43135 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr2f2P43135 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr2f2P43135 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr2f2P43135 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr2f2P43135 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr2f2P43135 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr2f2P43135 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr2f2P43135 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr2f2P43135 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr2f2P43135 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr2f2P43135 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr2f2P43135 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr2f2P43135 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr2f2P43135 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr2f2P43135 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr2f2P43135 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr2f2P43135 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr2f2P43135 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr2f2P43135 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr2f2P43135 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr2f2P43135 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr2f2P43135 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr2f2P43135 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr2f2P43135 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr2f2P43135 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr2f2P43135 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr2f2P43135 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nr2f2P43135 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nr2f2P43135 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nr2f2P43135 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms