Protein–RNA interactions for Protein: P43025

Clec3b, Tetranectin, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec3bP43025 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clec3bP43025 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clec3bP43025 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clec3bP43025 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clec3bP43025 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clec3bP43025 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Clec3bP43025 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Clec3bP43025 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clec3bP43025 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Clec3bP43025 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clec3bP43025 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clec3bP43025 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clec3bP43025 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clec3bP43025 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clec3bP43025 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clec3bP43025 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clec3bP43025 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clec3bP43025 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clec3bP43025 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clec3bP43025 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clec3bP43025 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Clec3bP43025 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clec3bP43025 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clec3bP43025 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clec3bP43025 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clec3bP43025 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clec3bP43025 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clec3bP43025 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clec3bP43025 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clec3bP43025 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Clec3bP43025 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clec3bP43025 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms