Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sept1P42209 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sept1P42209 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sept1P42209 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sept1P42209 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sept1P42209 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sept1P42209 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sept1P42209 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sept1P42209 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sept1P42209 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms