Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VhlP40338 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VhlP40338 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VhlP40338 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VhlP40338 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VhlP40338 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VhlP40338 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VhlP40338 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VhlP40338 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VhlP40338 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VhlP40338 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VhlP40338 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VhlP40338 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VhlP40338 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VhlP40338 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VhlP40338 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VhlP40338 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VhlP40338 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VhlP40338 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VhlP40338 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VhlP40338 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VhlP40338 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VhlP40338 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VhlP40338 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VhlP40338 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VhlP40338 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VhlP40338 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VhlP40338 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VhlP40338 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VhlP40338 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VhlP40338 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VhlP40338 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VhlP40338 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VhlP40338 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VhlP40338 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VhlP40338 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VhlP40338 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VhlP40338 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VhlP40338 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VhlP40338 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VhlP40338 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VhlP40338 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VhlP40338 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VhlP40338 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VhlP40338 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VhlP40338 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VhlP40338 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VhlP40338 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VhlP40338 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VhlP40338 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VhlP40338 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VhlP40338 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VhlP40338 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VhlP40338 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VhlP40338 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VhlP40338 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VhlP40338 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VhlP40338 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VhlP40338 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VhlP40338 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VhlP40338 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VhlP40338 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VhlP40338 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VhlP40338 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VhlP40338 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VhlP40338 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VhlP40338 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VhlP40338 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VhlP40338 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VhlP40338 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VhlP40338 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VhlP40338 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VhlP40338 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VhlP40338 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VhlP40338 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VhlP40338 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VhlP40338 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VhlP40338 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VhlP40338 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VhlP40338 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VhlP40338 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VhlP40338 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VhlP40338 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VhlP40338 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VhlP40338 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VhlP40338 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VhlP40338 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VhlP40338 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VhlP40338 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VhlP40338 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VhlP40338 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VhlP40338 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VhlP40338 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VhlP40338 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VhlP40338 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VhlP40338 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VhlP40338 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VhlP40338 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VhlP40338 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VhlP40338 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms