Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Chd1P40201 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Chd1P40201 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Chd1P40201 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Chd1P40201 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Chd1P40201 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Chd1P40201 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Chd1P40201 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Chd1P40201 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Chd1P40201 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Chd1P40201 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Chd1P40201 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Chd1P40201 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Chd1P40201 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Chd1P40201 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Chd1P40201 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Chd1P40201 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Chd1P40201 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Chd1P40201 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Chd1P40201 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Chd1P40201 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Chd1P40201 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Chd1P40201 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Chd1P40201 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Chd1P40201 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Chd1P40201 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Chd1P40201 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Chd1P40201 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Chd1P40201 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Chd1P40201 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Chd1P40201 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Chd1P40201 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Chd1P40201 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Chd1P40201 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Chd1P40201 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Chd1P40201 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Chd1P40201 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Chd1P40201 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Chd1P40201 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Chd1P40201 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Chd1P40201 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Chd1P40201 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Chd1P40201 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Chd1P40201 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Chd1P40201 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Chd1P40201 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Chd1P40201 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Chd1P40201 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Chd1P40201 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Chd1P40201 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Chd1P40201 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Chd1P40201 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Chd1P40201 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Chd1P40201 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Chd1P40201 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Chd1P40201 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Chd1P40201 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Chd1P40201 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Chd1P40201 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Chd1P40201 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Chd1P40201 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Chd1P40201 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Chd1P40201 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Chd1P40201 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Chd1P40201 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Chd1P40201 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Chd1P40201 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Chd1P40201 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Chd1P40201 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Chd1P40201 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Chd1P40201 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Chd1P40201 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms