Protein–RNA interactions for Protein: P40124

Cap1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cap1P40124 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cap1P40124 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cap1P40124 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cap1P40124 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cap1P40124 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cap1P40124 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cap1P40124 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cap1P40124 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cap1P40124 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cap1P40124 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cap1P40124 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cap1P40124 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cap1P40124 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cap1P40124 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cap1P40124 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cap1P40124 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cap1P40124 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cap1P40124 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cap1P40124 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cap1P40124 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cap1P40124 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cap1P40124 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cap1P40124 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cap1P40124 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cap1P40124 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cap1P40124 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cap1P40124 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cap1P40124 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cap1P40124 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cap1P40124 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cap1P40124 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cap1P40124 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cap1P40124 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cap1P40124 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cap1P40124 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cap1P40124 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cap1P40124 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cap1P40124 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cap1P40124 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cap1P40124 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cap1P40124 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cap1P40124 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cap1P40124 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cap1P40124 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cap1P40124 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cap1P40124 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms