Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timp3P39876 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Timp3P39876 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Timp3P39876 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Timp3P39876 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Timp3P39876 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Timp3P39876 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timp3P39876 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Timp3P39876 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Timp3P39876 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Timp3P39876 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms