Protein–RNA interactions for Protein: P35979

Rpl12, 60S ribosomal protein L12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl12P35979 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl12P35979 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl12P35979 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms