Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Grin2aP35436 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Grin2aP35436 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Grin2aP35436 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Grin2aP35436 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
Grin2aP35436 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Grin2aP35436 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Grin2aP35436 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
Grin2aP35436 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
Grin2aP35436 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
Grin2aP35436 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Grin2aP35436 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Grin2aP35436 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Grin2aP35436 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Grin2aP35436 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Grin2aP35436 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Grin2aP35436 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Grin2aP35436 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Grin2aP35436 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Grin2aP35436 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Grin2aP35436 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Grin2aP35436 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Grin2aP35436 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Grin2aP35436 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Grin2aP35436 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Grin2aP35436 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Grin2aP35436 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Grin2aP35436 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Grin2aP35436 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Grin2aP35436 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Grin2aP35436 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Grin2aP35436 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Grin2aP35436 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Grin2aP35436 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Grin2aP35436 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Grin2aP35436 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Grin2aP35436 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Grin2aP35436 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Grin2aP35436 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Grin2aP35436 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Grin2aP35436 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Grin2aP35436 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Grin2aP35436 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Grin2aP35436 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Grin2aP35436 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Grin2aP35436 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Grin2aP35436 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Grin2aP35436 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Grin2aP35436 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Grin2aP35436 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Grin2aP35436 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Grin2aP35436 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Grin2aP35436 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Grin2aP35436 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Grin2aP35436 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Grin2aP35436 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Grin2aP35436 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Grin2aP35436 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Grin2aP35436 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Grin2aP35436 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Grin2aP35436 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Grin2aP35436 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Grin2aP35436 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Grin2aP35436 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Grin2aP35436 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Grin2aP35436 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Grin2aP35436 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Grin2aP35436 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Grin2aP35436 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Grin2aP35436 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Grin2aP35436 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Grin2aP35436 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Grin2aP35436 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Grin2aP35436 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Grin2aP35436 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Grin2aP35436 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Grin2aP35436 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Grin2aP35436 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC30.89■■■□□ 2.53
Grin2aP35436 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC30.89■■■□□ 2.53
Grin2aP35436 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Grin2aP35436 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Grin2aP35436 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Grin2aP35436 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Grin2aP35436 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Grin2aP35436 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Grin2aP35436 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Grin2aP35436 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Grin2aP35436 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Grin2aP35436 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Grin2aP35436 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Grin2aP35436 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Grin2aP35436 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Grin2aP35436 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Grin2aP35436 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Grin2aP35436 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Grin2aP35436 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Grin2aP35436 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Grin2aP35436 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Grin2aP35436 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Grin2aP35436 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms