Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sftpa1P35242 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms