Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mmp12P34960 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mmp12P34960 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mmp12P34960 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms