Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Apoc1P34928 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Apoc1P34928 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoc1P34928 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms