Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ifnar1P33896 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ifnar1P33896 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifnar1P33896 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms