Protein–RNA interactions for Protein: P32883

Kras, GTPase KRas, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KrasP32883 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KrasP32883 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KrasP32883 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KrasP32883 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KrasP32883 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KrasP32883 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KrasP32883 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
KrasP32883 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KrasP32883 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KrasP32883 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KrasP32883 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KrasP32883 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KrasP32883 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KrasP32883 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KrasP32883 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KrasP32883 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KrasP32883 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KrasP32883 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KrasP32883 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KrasP32883 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KrasP32883 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KrasP32883 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KrasP32883 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KrasP32883 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KrasP32883 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KrasP32883 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KrasP32883 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KrasP32883 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KrasP32883 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KrasP32883 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KrasP32883 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KrasP32883 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KrasP32883 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KrasP32883 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KrasP32883 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KrasP32883 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KrasP32883 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KrasP32883 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KrasP32883 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KrasP32883 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KrasP32883 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KrasP32883 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KrasP32883 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KrasP32883 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KrasP32883 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KrasP32883 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KrasP32883 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KrasP32883 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KrasP32883 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KrasP32883 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KrasP32883 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KrasP32883 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KrasP32883 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KrasP32883 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KrasP32883 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KrasP32883 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KrasP32883 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KrasP32883 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KrasP32883 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KrasP32883 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KrasP32883 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KrasP32883 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KrasP32883 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KrasP32883 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KrasP32883 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KrasP32883 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KrasP32883 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KrasP32883 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KrasP32883 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KrasP32883 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KrasP32883 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KrasP32883 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KrasP32883 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KrasP32883 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KrasP32883 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KrasP32883 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KrasP32883 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KrasP32883 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KrasP32883 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KrasP32883 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KrasP32883 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KrasP32883 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KrasP32883 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KrasP32883 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KrasP32883 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KrasP32883 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KrasP32883 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KrasP32883 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KrasP32883 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KrasP32883 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KrasP32883 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KrasP32883 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KrasP32883 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KrasP32883 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
KrasP32883 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KrasP32883 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KrasP32883 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KrasP32883 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KrasP32883 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KrasP32883 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms