Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc5P32043 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hoxc5P32043 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc5P32043 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms