Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa11P31311 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxa11P31311 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hoxa11P31311 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms