Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk4P30285 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk4P30285 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk4P30285 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cdk4P30285 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cdk4P30285 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk4P30285 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk4P30285 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cdk4P30285 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk4P30285 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk4P30285 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk4P30285 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk4P30285 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk4P30285 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk4P30285 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk4P30285 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk4P30285 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk4P30285 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk4P30285 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk4P30285 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk4P30285 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk4P30285 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk4P30285 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk4P30285 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk4P30285 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk4P30285 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk4P30285 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk4P30285 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk4P30285 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk4P30285 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk4P30285 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk4P30285 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk4P30285 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk4P30285 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk4P30285 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk4P30285 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk4P30285 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk4P30285 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk4P30285 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cdk4P30285 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk4P30285 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk4P30285 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk4P30285 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk4P30285 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk4P30285 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk4P30285 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk4P30285 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk4P30285 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms