Protein–RNA interactions for Protein: P30280

Ccnd2, G1/S-specific cyclin-D2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd2P30280 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccnd2P30280 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccnd2P30280 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccnd2P30280 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccnd2P30280 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccnd2P30280 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms