Protein–RNA interactions for Protein: P29758

Oat, Ornithine aminotransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OatP29758 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OatP29758 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OatP29758 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OatP29758 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OatP29758 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
OatP29758 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OatP29758 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OatP29758 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OatP29758 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OatP29758 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OatP29758 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
OatP29758 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OatP29758 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OatP29758 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
OatP29758 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OatP29758 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OatP29758 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OatP29758 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OatP29758 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OatP29758 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OatP29758 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OatP29758 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
OatP29758 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OatP29758 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OatP29758 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OatP29758 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OatP29758 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OatP29758 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OatP29758 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OatP29758 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OatP29758 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OatP29758 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OatP29758 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OatP29758 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OatP29758 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OatP29758 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OatP29758 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OatP29758 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OatP29758 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OatP29758 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OatP29758 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
OatP29758 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OatP29758 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OatP29758 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OatP29758 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OatP29758 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OatP29758 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OatP29758 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OatP29758 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
OatP29758 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OatP29758 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OatP29758 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OatP29758 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
OatP29758 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OatP29758 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OatP29758 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OatP29758 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OatP29758 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OatP29758 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
OatP29758 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
OatP29758 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OatP29758 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OatP29758 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OatP29758 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
OatP29758 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OatP29758 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OatP29758 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OatP29758 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OatP29758 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
OatP29758 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OatP29758 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OatP29758 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
OatP29758 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OatP29758 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OatP29758 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OatP29758 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OatP29758 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OatP29758 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OatP29758 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OatP29758 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OatP29758 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OatP29758 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OatP29758 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OatP29758 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OatP29758 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OatP29758 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OatP29758 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OatP29758 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OatP29758 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OatP29758 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OatP29758 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
OatP29758 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OatP29758 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OatP29758 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OatP29758 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OatP29758 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OatP29758 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OatP29758 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OatP29758 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OatP29758 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms