Protein–RNA interactions for Protein: P29416

Hexa, Beta-hexosaminidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HexaP29416 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HexaP29416 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HexaP29416 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HexaP29416 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HexaP29416 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HexaP29416 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HexaP29416 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HexaP29416 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HexaP29416 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HexaP29416 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HexaP29416 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HexaP29416 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HexaP29416 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HexaP29416 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HexaP29416 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HexaP29416 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HexaP29416 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HexaP29416 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HexaP29416 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HexaP29416 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HexaP29416 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HexaP29416 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HexaP29416 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HexaP29416 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HexaP29416 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HexaP29416 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HexaP29416 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HexaP29416 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HexaP29416 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HexaP29416 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HexaP29416 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HexaP29416 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HexaP29416 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HexaP29416 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HexaP29416 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HexaP29416 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HexaP29416 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HexaP29416 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HexaP29416 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HexaP29416 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HexaP29416 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HexaP29416 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HexaP29416 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HexaP29416 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HexaP29416 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HexaP29416 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HexaP29416 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HexaP29416 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HexaP29416 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HexaP29416 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HexaP29416 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HexaP29416 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HexaP29416 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HexaP29416 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HexaP29416 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HexaP29416 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HexaP29416 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HexaP29416 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HexaP29416 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HexaP29416 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HexaP29416 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HexaP29416 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HexaP29416 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HexaP29416 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
HexaP29416 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HexaP29416 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HexaP29416 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HexaP29416 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HexaP29416 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HexaP29416 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HexaP29416 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HexaP29416 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HexaP29416 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HexaP29416 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HexaP29416 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HexaP29416 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HexaP29416 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HexaP29416 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HexaP29416 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HexaP29416 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HexaP29416 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HexaP29416 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HexaP29416 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HexaP29416 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HexaP29416 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HexaP29416 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HexaP29416 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HexaP29416 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HexaP29416 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HexaP29416 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HexaP29416 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HexaP29416 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HexaP29416 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HexaP29416 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HexaP29416 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HexaP29416 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HexaP29416 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HexaP29416 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HexaP29416 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HexaP29416 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms