Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkcdP28867 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkcdP28867 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkcdP28867 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkcdP28867 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkcdP28867 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkcdP28867 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkcdP28867 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkcdP28867 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkcdP28867 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkcdP28867 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkcdP28867 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkcdP28867 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkcdP28867 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkcdP28867 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkcdP28867 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkcdP28867 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkcdP28867 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkcdP28867 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkcdP28867 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkcdP28867 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkcdP28867 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkcdP28867 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkcdP28867 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkcdP28867 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkcdP28867 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkcdP28867 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PrkcdP28867 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PrkcdP28867 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PrkcdP28867 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PrkcdP28867 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PrkcdP28867 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PrkcdP28867 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PrkcdP28867 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms