Protein–RNA interactions for Protein: P28661

Sept4, Septin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept4P28661 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sept4P28661 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sept4P28661 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sept4P28661 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sept4P28661 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sept4P28661 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sept4P28661 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sept4P28661 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sept4P28661 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sept4P28661 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sept4P28661 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sept4P28661 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sept4P28661 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sept4P28661 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sept4P28661 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sept4P28661 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sept4P28661 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sept4P28661 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sept4P28661 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sept4P28661 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sept4P28661 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sept4P28661 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sept4P28661 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sept4P28661 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sept4P28661 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sept4P28661 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sept4P28661 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sept4P28661 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sept4P28661 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sept4P28661 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sept4P28661 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sept4P28661 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sept4P28661 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sept4P28661 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sept4P28661 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sept4P28661 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sept4P28661 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sept4P28661 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sept4P28661 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sept4P28661 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sept4P28661 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sept4P28661 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sept4P28661 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sept4P28661 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sept4P28661 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sept4P28661 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sept4P28661 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sept4P28661 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sept4P28661 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sept4P28661 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sept4P28661 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sept4P28661 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sept4P28661 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sept4P28661 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sept4P28661 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sept4P28661 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sept4P28661 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sept4P28661 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sept4P28661 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sept4P28661 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sept4P28661 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sept4P28661 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sept4P28661 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sept4P28661 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sept4P28661 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sept4P28661 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sept4P28661 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sept4P28661 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sept4P28661 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sept4P28661 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sept4P28661 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sept4P28661 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sept4P28661 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sept4P28661 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sept4P28661 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sept4P28661 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sept4P28661 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sept4P28661 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sept4P28661 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sept4P28661 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sept4P28661 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sept4P28661 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sept4P28661 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sept4P28661 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sept4P28661 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sept4P28661 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sept4P28661 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Sept4P28661 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sept4P28661 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sept4P28661 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sept4P28661 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sept4P28661 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sept4P28661 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sept4P28661 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sept4P28661 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sept4P28661 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sept4P28661 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Sept4P28661 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sept4P28661 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sept4P28661 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms