Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjb1P28230 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjb1P28230 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms