Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pde6aP27664 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms