Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd40lgP27548 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd40lgP27548 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms