Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CftrP26361 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
CftrP26361 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CftrP26361 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CftrP26361 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CftrP26361 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CftrP26361 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CftrP26361 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CftrP26361 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CftrP26361 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CftrP26361 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CftrP26361 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CftrP26361 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CftrP26361 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CftrP26361 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CftrP26361 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CftrP26361 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CftrP26361 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CftrP26361 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CftrP26361 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CftrP26361 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CftrP26361 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CftrP26361 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CftrP26361 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CftrP26361 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CftrP26361 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.97
CftrP26361 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CftrP26361 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CftrP26361 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CftrP26361 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CftrP26361 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CftrP26361 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CftrP26361 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CftrP26361 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CftrP26361 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CftrP26361 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CftrP26361 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CftrP26361 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CftrP26361 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CftrP26361 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CftrP26361 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CftrP26361 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CftrP26361 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CftrP26361 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CftrP26361 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CftrP26361 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CftrP26361 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CftrP26361 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CftrP26361 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CftrP26361 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CftrP26361 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CftrP26361 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CftrP26361 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
CftrP26361 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CftrP26361 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CftrP26361 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CftrP26361 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CftrP26361 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
CftrP26361 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CftrP26361 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CftrP26361 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CftrP26361 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
CftrP26361 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
CftrP26361 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CftrP26361 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CftrP26361 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CftrP26361 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
CftrP26361 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CftrP26361 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CftrP26361 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CftrP26361 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CftrP26361 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
CftrP26361 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CftrP26361 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CftrP26361 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CftrP26361 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CftrP26361 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CftrP26361 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CftrP26361 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CftrP26361 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CftrP26361 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CftrP26361 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CftrP26361 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CftrP26361 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CftrP26361 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CftrP26361 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CftrP26361 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CftrP26361 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CftrP26361 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CftrP26361 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CftrP26361 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CftrP26361 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CftrP26361 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
CftrP26361 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CftrP26361 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CftrP26361 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CftrP26361 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CftrP26361 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CftrP26361 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CftrP26361 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms