Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmo2P25801 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmo2P25801 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmo2P25801 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmo2P25801 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmo2P25801 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmo2P25801 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmo2P25801 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmo2P25801 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmo2P25801 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmo2P25801 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmo2P25801 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmo2P25801 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmo2P25801 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmo2P25801 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmo2P25801 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmo2P25801 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmo2P25801 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmo2P25801 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmo2P25801 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmo2P25801 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmo2P25801 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmo2P25801 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmo2P25801 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmo2P25801 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmo2P25801 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmo2P25801 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmo2P25801 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmo2P25801 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmo2P25801 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmo2P25801 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmo2P25801 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmo2P25801 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmo2P25801 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmo2P25801 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmo2P25801 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmo2P25801 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmo2P25801 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmo2P25801 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmo2P25801 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmo2P25801 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lmo2P25801 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms