Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gria1P23818 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gria1P23818 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gria1P23818 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gria1P23818 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gria1P23818 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gria1P23818 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gria1P23818 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gria1P23818 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gria1P23818 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.6 ms