Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ggta1P23336 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ggta1P23336 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms