Protein–RNA interactions for Protein: P22339

Gadd45b, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45bP22339 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gadd45bP22339 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gadd45bP22339 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gadd45bP22339 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gadd45bP22339 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gadd45bP22339 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gadd45bP22339 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gadd45bP22339 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gadd45bP22339 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gadd45bP22339 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gadd45bP22339 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gadd45bP22339 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gadd45bP22339 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gadd45bP22339 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gadd45bP22339 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gadd45bP22339 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gadd45bP22339 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gadd45bP22339 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gadd45bP22339 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gadd45bP22339 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gadd45bP22339 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gadd45bP22339 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gadd45bP22339 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gadd45bP22339 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gadd45bP22339 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gadd45bP22339 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gadd45bP22339 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gadd45bP22339 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gadd45bP22339 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gadd45bP22339 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gadd45bP22339 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gadd45bP22339 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gadd45bP22339 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gadd45bP22339 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gadd45bP22339 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gadd45bP22339 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gadd45bP22339 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gadd45bP22339 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms