Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prim1P20664 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prim1P20664 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Prim1P20664 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prim1P20664 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prim1P20664 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prim1P20664 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Prim1P20664 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prim1P20664 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prim1P20664 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prim1P20664 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prim1P20664 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prim1P20664 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prim1P20664 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prim1P20664 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prim1P20664 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prim1P20664 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prim1P20664 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prim1P20664 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prim1P20664 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prim1P20664 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prim1P20664 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prim1P20664 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prim1P20664 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prim1P20664 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prim1P20664 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prim1P20664 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prim1P20664 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prim1P20664 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Prim1P20664 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prim1P20664 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prim1P20664 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prim1P20664 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prim1P20664 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prim1P20664 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prim1P20664 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prim1P20664 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prim1P20664 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prim1P20664 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prim1P20664 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prim1P20664 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prim1P20664 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prim1P20664 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prim1P20664 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prim1P20664 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prim1P20664 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prim1P20664 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prim1P20664 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prim1P20664 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prim1P20664 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prim1P20664 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prim1P20664 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prim1P20664 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prim1P20664 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prim1P20664 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms