Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcaP20444 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms