Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P20040 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P20040 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P20040 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P20040 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P20040 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P20040 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P20040 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P20040 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
P20040 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P20040 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P20040 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P20040 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P20040 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P20040 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P20040 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P20040 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P20040 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P20040 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P20040 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P20040 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P20040 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P20040 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P20040 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
P20040 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P20040 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P20040 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P20040 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P20040 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P20040 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P20040 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P20040 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P20040 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P20040 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P20040 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P20040 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P20040 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P20040 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P20040 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P20040 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P20040 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P20040 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
P20040 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P20040 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
P20040 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
P20040 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P20040 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P20040 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P20040 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P20040 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P20040 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P20040 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P20040 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P20040 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P20040 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P20040 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P20040 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P20040 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P20040 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P20040 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P20040 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
P20040 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
P20040 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P20040 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P20040 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P20040 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P20040 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P20040 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P20040 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P20040 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P20040 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P20040 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P20040 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P20040 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P20040 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P20040 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P20040 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P20040 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P20040 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P20040 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P20040 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P20040 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P20040 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P20040 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P20040 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P20040 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P20040 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P20040 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P20040 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P20040 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P20040 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P20040 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P20040 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P20040 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P20040 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P20040 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P20040 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P20040 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
P20040 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P20040 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms