Protein–RNA interactions for Protein: P17225

Ptbp1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptbp1P17225 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptbp1P17225 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms