Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Gabra6P16305 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabra6P16305 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms