Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp53P15975 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp53P15975 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp53P15975 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp53P15975 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp53P15975 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp53P15975 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp53P15975 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp53P15975 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp53P15975 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp53P15975 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp53P15975 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp53P15975 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp53P15975 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms