Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd5P13379 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd5P13379 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd5P13379 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd5P13379 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd5P13379 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd5P13379 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd5P13379 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd5P13379 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd5P13379 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd5P13379 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd5P13379 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd5P13379 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd5P13379 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd5P13379 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd5P13379 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd5P13379 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd5P13379 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd5P13379 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd5P13379 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd5P13379 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd5P13379 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd5P13379 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd5P13379 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd5P13379 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd5P13379 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd5P13379 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd5P13379 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd5P13379 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd5P13379 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd5P13379 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd5P13379 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd5P13379 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd5P13379 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd5P13379 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd5P13379 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd5P13379 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd5P13379 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd5P13379 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd5P13379 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd5P13379 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd5P13379 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd5P13379 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd5P13379 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd5P13379 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd5P13379 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd5P13379 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd5P13379 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms