Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl1P12850 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms