Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb2P0C1T1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms