Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Surf1P09925 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Surf1P09925 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Surf1P09925 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Surf1P09925 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Surf1P09925 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Surf1P09925 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Surf1P09925 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Surf1P09925 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Surf1P09925 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Surf1P09925 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Surf1P09925 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Surf1P09925 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Surf1P09925 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Surf1P09925 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Surf1P09925 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Surf1P09925 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Surf1P09925 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Surf1P09925 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Surf1P09925 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Surf1P09925 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Surf1P09925 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Surf1P09925 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Surf1P09925 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Surf1P09925 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Surf1P09925 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Surf1P09925 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Surf1P09925 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Surf1P09925 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Surf1P09925 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Surf1P09925 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Surf1P09925 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Surf1P09925 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Surf1P09925 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Surf1P09925 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Surf1P09925 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Surf1P09925 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Surf1P09925 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Surf1P09925 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Surf1P09925 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Surf1P09925 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms