Protein–RNA interactions for Protein: P09920

Csf3, Granulocyte colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3P09920 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Csf3P09920 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf3P09920 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf3P09920 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csf3P09920 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csf3P09920 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csf3P09920 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csf3P09920 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csf3P09920 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csf3P09920 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms