Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd3P09027 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd3P09027 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd3P09027 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd3P09027 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd3P09027 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd3P09027 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd3P09027 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd3P09027 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd3P09027 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd3P09027 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd3P09027 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd3P09027 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd3P09027 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd3P09027 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd3P09027 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd3P09027 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd3P09027 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd3P09027 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd3P09027 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd3P09027 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd3P09027 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd3P09027 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd3P09027 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd3P09027 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd3P09027 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd3P09027 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd3P09027 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd3P09027 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd3P09027 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd3P09027 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd3P09027 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd3P09027 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd3P09027 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd3P09027 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd3P09027 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd3P09027 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd3P09027 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd3P09027 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd3P09027 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd3P09027 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd3P09027 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd3P09027 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd3P09027 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd3P09027 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd3P09027 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd3P09027 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd3P09027 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms