Protein–RNA interactions for Protein: P08923

Ltk, Leukocyte tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtkP08923 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LtkP08923 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LtkP08923 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LtkP08923 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LtkP08923 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LtkP08923 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LtkP08923 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LtkP08923 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LtkP08923 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LtkP08923 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LtkP08923 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LtkP08923 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LtkP08923 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LtkP08923 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LtkP08923 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LtkP08923 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LtkP08923 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LtkP08923 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LtkP08923 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LtkP08923 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LtkP08923 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LtkP08923 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LtkP08923 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LtkP08923 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LtkP08923 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LtkP08923 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LtkP08923 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LtkP08923 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LtkP08923 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LtkP08923 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LtkP08923 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LtkP08923 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LtkP08923 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LtkP08923 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LtkP08923 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LtkP08923 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LtkP08923 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LtkP08923 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LtkP08923 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LtkP08923 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LtkP08923 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LtkP08923 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LtkP08923 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LtkP08923 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LtkP08923 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LtkP08923 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LtkP08923 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LtkP08923 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LtkP08923 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LtkP08923 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LtkP08923 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LtkP08923 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LtkP08923 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LtkP08923 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LtkP08923 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LtkP08923 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LtkP08923 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LtkP08923 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LtkP08923 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LtkP08923 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LtkP08923 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LtkP08923 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LtkP08923 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LtkP08923 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LtkP08923 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LtkP08923 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LtkP08923 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LtkP08923 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LtkP08923 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LtkP08923 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LtkP08923 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LtkP08923 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LtkP08923 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LtkP08923 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LtkP08923 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LtkP08923 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LtkP08923 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LtkP08923 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LtkP08923 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LtkP08923 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LtkP08923 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LtkP08923 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LtkP08923 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LtkP08923 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LtkP08923 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LtkP08923 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LtkP08923 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LtkP08923 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LtkP08923 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LtkP08923 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LtkP08923 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LtkP08923 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LtkP08923 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LtkP08923 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LtkP08923 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LtkP08923 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LtkP08923 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LtkP08923 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LtkP08923 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LtkP08923 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms