Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spta1P08032 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Spta1P08032 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spta1P08032 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Spta1P08032 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spta1P08032 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spta1P08032 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spta1P08032 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spta1P08032 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms