Protein–RNA interactions for Protein: P07349

Ifna5, Interferon alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna5P07349 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifna5P07349 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna5P07349 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms