Protein–RNA interactions for Protein: P07214

Sparc, SPARC, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SparcP07214 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SparcP07214 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SparcP07214 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SparcP07214 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SparcP07214 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SparcP07214 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SparcP07214 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SparcP07214 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SparcP07214 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SparcP07214 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SparcP07214 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SparcP07214 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SparcP07214 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SparcP07214 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SparcP07214 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SparcP07214 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SparcP07214 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SparcP07214 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SparcP07214 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SparcP07214 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SparcP07214 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SparcP07214 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SparcP07214 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SparcP07214 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SparcP07214 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SparcP07214 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SparcP07214 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SparcP07214 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SparcP07214 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SparcP07214 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SparcP07214 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SparcP07214 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SparcP07214 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SparcP07214 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SparcP07214 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SparcP07214 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SparcP07214 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SparcP07214 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SparcP07214 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SparcP07214 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SparcP07214 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SparcP07214 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SparcP07214 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SparcP07214 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SparcP07214 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SparcP07214 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SparcP07214 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SparcP07214 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SparcP07214 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SparcP07214 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SparcP07214 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SparcP07214 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SparcP07214 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SparcP07214 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SparcP07214 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SparcP07214 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SparcP07214 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SparcP07214 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SparcP07214 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SparcP07214 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SparcP07214 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SparcP07214 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SparcP07214 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SparcP07214 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SparcP07214 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SparcP07214 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SparcP07214 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SparcP07214 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SparcP07214 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SparcP07214 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SparcP07214 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SparcP07214 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SparcP07214 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SparcP07214 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SparcP07214 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SparcP07214 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SparcP07214 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SparcP07214 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SparcP07214 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SparcP07214 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SparcP07214 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SparcP07214 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SparcP07214 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SparcP07214 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SparcP07214 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SparcP07214 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SparcP07214 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SparcP07214 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SparcP07214 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SparcP07214 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SparcP07214 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SparcP07214 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SparcP07214 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SparcP07214 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SparcP07214 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SparcP07214 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SparcP07214 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SparcP07214 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SparcP07214 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SparcP07214 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms