Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2-Ab1P01921 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-Ab1P01921 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms