Protein–RNA interactions for Protein: P01915

H-2 class II histocompatibility antigen, E-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01915 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01915 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01915 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01915 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01915 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01915 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01915 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01915 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01915 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01915 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01915 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01915 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01915 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01915 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01915 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01915 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01915 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01915 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01915 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01915 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
P01915 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01915 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01915 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01915 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01915 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01915 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01915 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01915 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01915 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01915 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01915 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01915 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01915 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01915 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01915 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01915 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01915 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01915 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01915 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01915 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01915 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01915 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01915 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01915 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01915 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01915 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01915 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01915 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01915 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01915 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01915 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01915 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01915 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01915 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01915 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01915 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01915 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01915 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01915 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01915 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01915 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01915 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01915 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01915 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01915 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01915 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01915 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01915 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01915 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01915 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01915 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01915 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01915 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01915 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01915 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01915 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01915 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01915 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01915 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01915 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01915 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01915 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01915 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01915 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01915 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01915 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01915 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01915 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01915 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01915 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01915 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01915 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01915 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01915 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01915 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01915 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01915 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01915 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01915 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01915 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms